Institut za javne financije ima bogatu izdavačku djelatnost.
U redakciji Poreznog vjesnika uređuje se mjesečnik Porezni vjesnik i prateća izdanja - posebni brojevi Poreznog vjesnika te redovita izdanja poreznih priručnika. Redakcija povremeno objavljuje tekstove propisa koji su nužni za rad i praćenje stručnih tekstova porezne tematike, kao npr. Opći porezni zakon, Direktive o PDV-u i sl.
Redakcija Carinskog vjesnika mjesečno izdaje stručni časopis Carinski vjesnik. Također, prema potrebi, objavljuje posebne brojeve i druga izdanja iz područja carinskog i trošarinskog sustava i sustava carinske i izvancarinske zaštite.
Časopis Public Sector Economics objavljuje znanstvene članke s područja ekonomike javnog sektora. Svi objavljeni članci podvrgnuti su strogom recenzentskom postupku međunarodnih recenzenata, a časopis je uvršten u brojne baze citiranosti. Od 1976. izlazi prvo pod nazivom Financijska praksa (kasnije Financijska teorija i praksa), a od 2011. objavljuje se samo na engleskom jeziku pod nazivom Financial Theory and Practice. Godine 2017. mijenja naziv u Public Sector Economics.
U Newsletteru i Osvrtima Instituta za javne financije istaživači objavljuju razmatranja i pojašnjenja aktualnih pitanja s područja javnih financija. Ta su izdanja pisana na jednostavniji način i prvenstveno su upućena široj publici i medijima. Od 2016. do 2019. Institut je objavljivao i časopis Fiscus, a nakon toga izdavač je Znanstveno društvo ekonomista.