Upravno vijeće Instituta za javne financije ima pet članova, od kojih predsjednika i dva člana Upravnog vijeća imenuje Ministarstvo znanosti, obrazovanja i sporta, jednog člana tajnim glasovanjem izabiru članovi Znanstvenoga vijeća Instituta, a jednog člana imenuju i opozivaju radnici Instituta neposrednim i tajnim glasovanjem. Mandat članova Upravnog vijeća traje četiri godine.

Članovi Upravnog vijeća Instituta za javne financije su:

prof. dr. sc. Ivan Pavić, Ekonomski fakultet Split (predsjednik)
prof. dr. sc. Zoran Jašić
Gordan Kuvek, HBOR
dr. sc. Josip Franić, Institut za javne financije, predstavnik Znanstvenog vijeća
Irena Klemenčić, mag. iur., Institut za javne financije, predstavnica radnika