Agencija za znanost i visoko obrazovanje provela je tijekom 2013. godine postupak reakreditacije znanstvenih organizacija. Svrha je reakreditacije bila vanjsko vrednovanje kvalitete  s temeljnim ciljem osiguravanja ali i unaprjeđenja kvalitete znanstvene djelatnosti. Neki od kriterija za vrednovanje znanstvenih instituta bili su kvaliteta, produktivnost, utjecaj i značaj znanstvenog istraživanja te efikasnost i racionalnost znanstvene organizacije.

Stručno povjerenstvo posjetilo je Institut 16. listopada 2013., a obavezan dio protokola posjeta bili su odvojeni sastanci s upravom Instituta, predstavnicima znanstveno-istraživačkog osoblja i vanjskim dionicima Instituta.

U prosincu 2013. godine objavljeno je Izvješće o reakreditaciji na koje se Institut očitovao u veljači 2014.

Izvješća o reakreditaciji ostalih javnih instituta te njihova očitovanja dostupni su na mrežnim stranicama Agencije za znanost i visoko obrazovanje.